Admira Wacker Mödling

Sabitzer thi đấu cho Admira Wacker Mödling trong khoảng thời gian từ tháng 9 năm 2010 đến tháng 1 năm 2013.[2] Anh đã ghi được 2 bàn thắng trong 8 lần ra sân tại giải Bundesliga Áo mùa 2010–11.[3]

Rapid Wien

Sau đó, anh chuyển sang khoác áo Rapid Wien từ tháng 1 năm 2013 đến tháng 6 năm 2014.[2]

RB Leipzig

Cho mượn đến Red Bull Salzburg

Ngày 30 tháng 5 năm 2014, anh ký hợp đồng 4 năm với RB Leipzig và được cho Red Bull Salzburg mượn một mùa giải.[4] Tại đây, anh ghi được 27 bàn thắng sau 51 lần ra sân trên mọi đấu trường. Vào ngày 1 tháng 4 năm 2016, Sabitzer được Leipzig gia hạn hợp đồng đến năm 2021.[5]

Trở lại RB Leipzig

Sabitzer trở lại RB Leipzig trong mùa giải 2015–16 và trở thành nhân tố quan trọng giúp câu lạc bộ thăng hạng.

Ngày 10 tháng 3 năm 2020, Sabitzer ghi hai bàn trong chiến thắng 3–0 trước Tottenham Hotspur ở vòng 16 đội Champions League. Leipzig giành chiến thắng chung cuộc 4–0 và có lần đầu tiên trong lịch sử câu lạc bộ đặt chân vào tứ kết giải đấu danh giá nhất châu Âu.[6]